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Text File  |  1995-03-04  |  1.7 KB  |  36 lines
  1. ********************************************
  2. * Coproporphyrinogen III oxidase signature *
  3. ********************************************
  4.  
  5. Coproporphyrinogen III  oxidase  (EC  1.3.3.3)  (coproporphyrinogenase)  [1,2]
  6. catalyzes the   oxidative   decarboxylation  of  coproporphyrinogen  III  into
  7. protoporphyrinogen IX,   a common step in the pathway for the biosynthesis  of
  8. porphyrins such as heme, chlorophyll or cobalamin.
  9.  
  10. Coproporphyrinogen III  oxidase  is  an  enzyme  that  requires  iron  for its
  11. activity. A  cysteine  seems  to be important for the catalytic mechanism [3].
  12. Sequences from a  variety  of  eukaryotic  and  prokaryotic  sources show that
  13. this enzyme  has  been  evolutionarily  conserved.  As  a signature pattern we
  14. selected a  highly  conserved region in the central part of the sequence; this
  15. region contains  the  only  conserved  cysteine  and  is rich in charged amino
  16. acids.
  17.  
  18. -Consensus pattern: K-K-W-C-D-[DE]-[FY](3)-[LIVM]-x-H-R-x-E-x-R-G-[LIVM]-G-G-
  19.                     [LIVM]-F-F-D-D
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22.  
  23. -Note: an  anaerobic  form  of coproporphyrinogen III oxidase from Rhodobacter
  24.  sphaeroides has been sequenced [4]. It does not belong to this family.
  25.  
  26. -Last update: June 1994 / First entry.
  27.  
  28. [ 1] Xu K., Elliott T.
  29.      J. Bacteriol. 175:4990-4999(1993).
  30. [ 2] Kohno H., Furukawa T., Yoshinaga T., Tokunaga R., Taketani S.
  31.      J. Biol. Chem. 268:21359-21363(1993).
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  33.      Eur. J. Biochem. 156:579-587(1986).
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  35.      Mol. Microbiol. 6:3159-3169(1992).
  36.